Serge Sakharov effectue l’essentiel de sa formation professionnelle auprès du grand violoniste et pédagogue bulgare Georg Baynov, professeur à la Staatliche Hochschule für Musik de Trossingen (Allemagne). Il participe en 1988 au Festival de musique du Schleswig-Holstein, sous la direction de Leonard Bernstein. En 1990, Serge Sakharov intègre brièvement la Philharmonie de Lorraine, avant de rejoindre au cours de la même année, l’Orchestre Philharmonique de Strasbourg où il s'enrichit de la présence régulière d'éminents chefs d'orchestres tels que Jerzy Semkov, Guennady Rozhdestvensky, Valentin Kojine, Yuri Ahronovitch, Leif Segerstam, Armin Jordan, Vassili Sinaisky, John Nelson, Claus Peter Flor.

En parallèle, il consacre une bonne partie de son temps au sein de diverses formations musicales (Compagnie Brin de folie, l'ensemble Balagan et les Strasbuskers).